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日本人ゲノム解析ツール「ジャポニカアレイ®」を用いたゲノム解析サービスを開始

2014年12月01日
ジャポニカアレイの写真
日本人ゲノム解析ツール「ジャポニカアレイ(R)」

 当社は、大学、病院臨床部門、製薬企業などの研究機関向けに、日本人ゲノム解析ツール「ジャポニカアレイ®」を用いたゲノム解析サービスを本日から開始します。

 ジャポニカアレイ®を用いたゲノム解析サービスは、当社のライフサイエンス解析センターにて、研究機関から送付された血液、唾液、DNA検体などから個人のゲノム構造を解析するサービスです。疾病や習性等と遺伝子の因果関係を解明する研究機関向けに解析結果を提供することで、個別化予防・個別化医療の実現を加速させるとともに、この分野における日本の国際競争力向上に貢献していきます。

 従来、次世代シーケンサーを用いて約30億塩基のゲノム構造を解析する場合、解析には1ヶ月以上の時間がかかりました。また、スーパーコンピュータの使用、データ解析を行う専門の研究者などのインフラが必要なため、1人当たり50万円以上の解析費用が必要で、大規模なサンプルの解析を行うには莫大な時間と費用がかかっていました。新サービスは、日本人に特徴的な遺伝情報を短時間で解読可能なジャポニカアレイ®を活用することで、解析に約1週間、1人当たり19800円注1(税抜)でゲノム解析を実現します。

 ジャポニカアレイ®は、東北大学東北メディカル・メガバンク機構注2が構築した「全ゲノムリファレンスパネル」を基に、COI東北拠点注3が社会実装した日本人ゲノム解析ツールです。日本人に特徴的な塩基注4配列を持つ約67.5万箇所の一塩基多型(SNP:スニップ注5)を1枚のチップに搭載しており、短時間で日本人のゲノム構造を解析するツールです。その解析結果から約30億塩基の全ゲノム構造を疑似的に再構成(インピュテーション注6)できる設計となっています。

 ジャポニカアレイ®は高品質かつコスト競争力のある米・アフィメトリクス社製のAxiom® プラットフォームを採用し、独自のコンテンツでカスタムデザインされたアレイです。
また、新サービスは東北大学、弘前大学、新潟大学での利用を予定しており、今後も研究拠点や製薬会社での採用を目指します。

 当社は今後もCOI東北拠点と継続し、異なる民族のそれぞれ特徴的な塩基を見出していくことで「エスニックアレイ」を開発するなど積極的に事業を展開していきます。

アフィメトリクス社のFrank Witney, president and CEOのコメント

株式会社東芝と東北大学が開発したジャポニカアレイ®を用いたゲノム解析サービスにおいて、その重要なカスタムジェノタイピングアレイのデザインに携われたことを大変光栄に思います。また、当社のAxiom® ジェノタイピングソリューションをプラットフォームに選んで頂いたことはさらに名誉なことであります。
この技術を用いた研究は日本人に特有の遺伝子と疾病の関連性に新しい知見をもたらし、究極的にはすべての日本人の健康と福祉の増進につながるものと確信しております。

注1
血液や唾液などからDNA検体の抽出が必要な場合は別途費用がかかります。
注2
東北大学東北メディカル・メガバンク機構(ToMMo) URL: http://www.megabank.tohoku.ac.jp/
注3
COI東北拠点(東北大学革新的イノベーション研究機構)
 参考 革新的イノベーション創出プログラム(COI STREAM) URL: http://www.mext.go.jp/a_menu/kagaku/coi/
 参考 センター・オブ・イノベーション(COI)プログラム URL: http://www.jst.go.jp/coi/outline/outline.html
注4
遺伝子の遺伝情報は塩基に保持されています。遺伝情報を構成する塩基はアデニン (A) 、グアニン (G) 、チミ 
ン(T) 、シトシン (C) の4種類。
注5
ある集団で、ゲノム塩基配列が一塩基のみ異なる多様性があり、その頻度が1%以上のものを一塩基多型(single
nucleotide polymorphism: SNP)と呼びます。
注6
インピュテーションゲノムリファレンスパネルを基に、遺伝子型の補完を行う処理。

※ジャポニカアレイ®は、国立大学法人東北大学の登録商標です。
※axiom®は、アフィメトリックス社の登録商標です。

新サービスに関するお問い合わせ先:

ヘルスケア社 営業統括部
TEL : 03(3457)3691
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